Фамилия Бабуков по своему строению — типичная русская фамилия с патронимическим суффиксом -ов, который указывает на принадлежность («чей?»). Основа здесь — Бабук. Вопрос лишь в том, что это за слово и кто именно мог получить такое прозвище.

Самая прямая версия отсылает к диалектному слову «бабук». В южнорусских и украинских говорах так могли называть старого деда, старика, а иногда — ворчливого или суеверного человека, который постоянно поминает бабьи приметы. Однако есть и другая, более конкретная гипотеза: «бабук» в некоторых регионах — это «бабий угодник», подкаблучник. Прозвище, конечно, не из лестных, но в крестьянской среде XV–XVII веков такие бытовые характеристики давали легко и без злого умысла, просто как меткую примету.

Менее очевидный, но возможный вариант — связь с тюркскими языками. В тюркском «баба» означает «отец», «дед», «предок», а «бабук» могло быть уменьшительной или уважительной формой (вроде «дедушка»). Это не редкость для русских фамилий, возникших на южных окраинах государства, где славянское население тесно контактировало с тюрками. В таком случае фамилия могла изначально принадлежать человеку, которого за почтенный возраст или степенный нрав прозвали на тюркский лад.

Что важно: фамилия Бабуков не относится к числу «княжеских» или «семинарских» (на -ский). Это фамилия крестьянская или посадская, образованная в народной среде. В документах она встречается с XVII века, в основном в центральных и южных губерниях России — там, где слово «бабук» было в ходу. Носитель фамилии почти наверняка происходил из простого сословия, а его предок получил прозвище за характер или возраст, а не за ремесло.