Фамилия Банатовская — редкий пример, когда географическая основа почти наверняка перевешивает личное прозвище. Самое вероятное объяснение: её корень — в названии исторической области Банат в Юго-Восточной Европе, в междуречье Муреша, Тисы и Дуная, ограниченной с востока Трансильванскими Альпами. Человек, получивший фамилию, либо родился в Банате, либо долго там жил, а затем переселился, например, на земли современной Украины, Беларуси или Польши, где распространён суффикс -ский/-ская, указывающий на принадлежность к местности.

Сам топоним Банат — исторический парадокс. Он происходит от слова «бан» (королевский наместник), то есть буквально означает «территория, управляемая баном». Однако, в отличие от других южнославянских областей, где баны реально назначались, в самом Банате такой должности никогда не существовало. Область принадлежала Венгрии, с середины XVI до начала XVIII века входила в состав Австрии, а в XVIII–XIX веках активно заселялась колонистами. В результате сложился пёстрый этнический состав: румыны, сербы, хорваты, венгры, словаки, немцы. Позже большая часть Баната отошла к Румынии, остальная — к Югославии. Фамилия Банатовская могла закрепиться за выходцами из любой из этих групп, которые оказались в восточнославянской среде.

Существует и вторая, менее убедительная гипотеза: от мусульманского женского имени Банат, которое с арабского переводится как «девушка», «девочки» или «девственность». В этом случае фамилия означала бы «потомок человека по прозвищу Банат». Но такое объяснение сталкивается с проблемой: суффикс -овская/-евская в русских и польских фамилиях почти всегда привязан к географическому названию, а не к личному имени, особенно восточного происхождения. К тому же арабское имя Банат — женское, а фамилии от женских имён в этой модели образуются крайне редко. Поэтому версия с топонимом Банат выглядит гораздо правдоподобнее, хотя и не исключает единичных случаев обратного.