Фамилия Банатина, судя по её окончанию, происходит от женского прозвища или имени — Баната. Модель образования здесь простая: к основе Банат- добавился суффикс -ин, который в русской традиции указывает на принадлежность: «чей?» — Банатин, то есть сын или потомок Банаты. В XIX веке такие фамилии часто давали по матери, если женщина была вдовой или главой дома, но в данном случае, скорее всего, это просто форма от мужского прозвища с уменьшительным суффиксом -ат(а), как, например, Косата от Косой или Горбата от Горбатый.

Само слово «банат» имеет несколько значений, и самое вероятное — географическое. Банат — историческая область в Центральной Европе, на стыке современных Венгрии, Сербии и Румынии. В XVIII–XIX веках это была территория Австрийской империи, откуда в Россию переселялись сербы, румыны и немцы. Прозвище Банат могли дать человеку, который приехал оттуда или имел с той землёй какую-то связь — например, торговал с банатскими купцами. Менее вероятно, но возможно, что в основе лежит диалектный глагол «банать» — так в некоторых русских говорах называли болтовню или пустые разговоры. Тогда Баната — прозвище говорливого человека.

Есть и третий, совсем редкий вариант: «банат» в южнорусских степях могли называть вид дикого лука или съедобной травы. Но эта версия слабая — нет подтверждений, что такое слово было широко распространено в фамилиях. Самая правдоподобная гипотеза — географическая, тем более что фамилия Банатина встречается в основном в Поволжье и на Урале, куда в XIX веке активно привлекали переселенцев из западных губерний и иностранцев.

Фамилия редкая, в списках дворянства или купечества не отмечена — её носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами. Ударение в ней, по законам русской грамматики, падает на второй слог: Бана́тина.