Фамилия Банифатов образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Банифатов послужило церковное имя Бонифатий (Вонифатий). Фамилия Банифатов образована от имени Банифат. Оно является краткой формой канонического мужского имени Бонифатий (Вонифатий), что в переводе с латинского означает «благотворный, благотворящий». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Банифат, со временем получил фамилию Банифатов. О точном месте и времени возникновения фамилии Банифатов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Банифатов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.