Фамилия Баохина — редкий случай, когда написание может сбить с толку даже опытного этимолога. На первый взгляд, перед нами классическая модель с суффиксом -ин, указывающая на принадлежность к женщине или жене: Баоха + -ин = «дочь или жена Баохи». Но загвоздка в том, что мужского имени или прозвища «Баоха» в русской антропонимии не зафиксировано. Поэтому логичнее предположить, что мы имеем дело не с исходной, а с изменённой формой.

Скорее всего, фамилия Баохина — это результат диалектного или канцелярского искажения более распространённой фамилии Баухина. В русских говорах, особенно на юге и востоке, звук [о] в безударном положении мог переходить в [а] на письме под влиянием «акающего» произношения. Так «Баухин» превратилось в «Баохин», а по женской линии — в «Баохина». Основа «Баух» восходит к прозвищу Бауха — так в некоторых регионах называли человека с большим животом, толстяка (от диалектного «баухать» — тяжело ступать, грузно ходить, или от «бауха» — брюхо, пузо).

Существует и альтернативная, более прозрачная версия: фамилия могла возникнуть от канонического имени Варфоломей. В народной речи это имя сокращали до Фоломей, а затем до Болохва, Болоха. Форма «Баоха» могла появиться как дальнейшее упрощение. Если принять эту гипотезу, то предок носительницы фамилии был крещёным человеком по имени Варфоломей, а его потомки получили прозвание по уличной форме имени.

В любом случае, фамилия Баохина — не дворянская и не старинная боярская. Она относится к крестьянской или мещанской среде, где прозвища давались по внешности, поведению или обиходным именам. Географически она могла закрепиться в областях, где было сильно «аканье»: в центральных и южнорусских губерниях, а также в Поволжье. Сегодня это редкая фамилия, и её носительницы, скорее всего, происходят из одного локального рода, где написание закрепилось случайно или по ошибке писаря.