Фамилия Баргутина — яркий пример того, как географическое название может стать основой для прозвища, а затем и фамилии. Её ядро — слово «Баргута», которое в русских говорах имело несколько значений. Чаще всего так называли крупную рыбу, например, белугу или осетра. В некоторых регионах «баргутой» могли прозвать неуклюжего, медлительного человека или, напротив, большого и сильного — по ассоциации с размерами рыбы. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Баргутина — это «дочь (или жена) Баргуты». Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, был сыном или дочерью человека по прозвищу Баргута.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с рекой Баргузин в Забайкалье. Однако для прямого заимствования форма «Баргутин» была бы более ожидаемой, чем «Баргута». Поэтому версия с прозвищем от названия рыбы выглядит более естественной для крестьянской среды средней полосы России, где такие фамилии были распространены.

Фамилия Баргутина — женская форма, мужской вариант — Баргутин. Она относится к так называемым «матронимическим» фамилиям, образованным не от имени отца, а от прозвища матери или жены. В русской традиции это встречается реже, чем отчества, но такие случаи известны, особенно если женщина играла заметную роль в хозяйстве или обладала яркой внешностью или характером. Встречаемость фамилии невысока, она сосредоточена в основном в центральных и северных областях России.

В словаре русских фамилий Б. Унбегауна нет прямого упоминания Баргутиной, но модель образования через -ина от прозвищ, оканчивающихся на -а (типа Баргута), описана как типовая для северных и центральных говоров. Таким образом, предки современных Баргутиных могли быть рыбаками, торговцами рыбой или просто людьми, получившими меткое уличное прозвище.