Фамилия Басенцян — характерный пример армянской модели фамилии, образованной с помощью суффикса -ян. Этот суффикс, восходящий к древнему -янц, указывал на принадлежность к роду или происхождение: «из дома такого-то». В русской традиции такие фамилии закрепились в форме на -ян или -ов/-ев, но Басенцян сохранила исходное армянское окончание.

Основа фамилии — Басенц — скорее всего, топонимическая. Она происходит от названия города Басен (историческая область в Западной Армении, на территории современной Турции, в верховьях Евфрата). Басен был важным центром, и выходцы оттуда получали прозвище Басенци — «басенец». Прибавление суффикса -ян превратило это прозвище в родовое имя: Басенцян буквально означает «потомок басенца» или «из Басена».

Менее вероятная, но возможная версия связывает основу с личным именем Басен, которое могло быть уменьшительной формой от более длинных армянских имен (например, Бабкен или Васак). Однако в ономастике предпочтение отдают топонимическому объяснению, так как оно встречается в армянской фамильной традиции массово и закономерно: фамилии на -ян от названий городов и сел — один из самых распространенных типов.

В Российской империи фамилия Басенцян фиксировалась преимущественно в Закавказье, особенно в Тифлисской и Эриванской губерниях, а также среди армянских общин юга России. Носители фамилии в XIX веке относились чаще к мещанскому или купеческому сословию, но встречались и среди крестьян. Судя по корню, предки Басенцян могли быть ремесленниками, торговцами или землевладельцами, переселившимися из исторического Басена в более крупные города.

В написании фамилии возможны варианты: Басенцян, реже Басенцан, а в старой орфографии — Басенцъянъ. Двойное «н» в основе — результат стяжения: Басен + ец + ян (где суффикс -ец указывал на жителя). Фамилия редкая, не входит в списки массовых армянских фамилий, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска — круг потенциальных родственников узок, и следы предков прослеживаются точнее.