Фамилия Бассагаринов — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает любую другую версию. Её основа — топоним, причём не российский, а центральноазиатский. Скорее всего, исходное название — Бассагари или Бассагара. Такие названия встречаются в Казахстане и Киргизии, часто в виде названий урочищ, зимовок или небольших речек. В тюркских языках «бас» означает «голова», «верховье», а «агар» или «гара» может указывать на течение, русло или быть частью сложного гидронима. Получается что-то вроде «головного ручья» или «верховья реки».

Модель образования фамилии — типичная русская патронимическая (по происхождению) с суффиксом -ов, который присоединили к тюркскому топониму. Суффикс -ин здесь был бы неуместен, так как основа не оканчивается на -а/-я. Форма «Бассагаринов» буквально означает «принадлежащий к роду из Бассагары» или «сын человека из Бассагары». Редкий суффикс -аринов (а не просто -аров) говорит о том, что исходное название было многосложным и, вероятно, заимствованным, а фамилию оформляли уже в русской канцелярской или церковной среде, где старались сохранить звучание основы.

По сословной принадлежности носители фамилии, скорее всего, не относились к дворянству. Такие фамилии на -ов от тюркских топонимов обычно получали казаки, крестьяне-переселенцы или мелкие служилые люди, осваивавшие южные и восточные окраины империи в XVIII–XIX веках. Встречается она в основном на юге Урала, в Оренбуржье, а также в среде оренбургских и сибирских казаков, где смешение тюркских и русских корней было обычным делом.

Спорных версий у фамилии практически нет. Попытка вывести её из арабского «бассар» (провидящий) или монгольского «багатур» (богатырь) потребовала бы слишком натянутых фонетических допущений. Топонимическая версия самая простая и правдоподобная: предки Бассагариновых жили в местности с таким названием, а при переписи или переходе на фамилию их записали по месту жительства.