Фамилия Батоширеев — редкий случай, когда в основе лежит не одно имя, а целая именная конструкция, собранная из двух бурятских (монгольских) корней. Она образована по типичной русской модели с суффиксом -ев, который присоединили к бурятскому имени Батоширей. В русской среде фамилии на -ев обычно указывали на принадлежность: «чей?» — Батоширеев, то есть сын или потомок Батоширея.

Разбираем имя-основу. Первая часть, «Бато», восходит к монгольскому «баатар» — «богатырь», «герой». Вторая часть, «ширей» (или «ширэй»), означает «стол», «престол», «трон». В буддийской традиции это слово часто входит в состав имён высших лам: например, «Ширээтэ» — настоятель дацана. Таким образом, Батоширей дословно переводится как «богатырь трона» или «герой престола». Имя составное, что характерно для бурятской антропонимии, где родители могли закладывать в имя пожелание силы и высокого положения.

С географической точки зрения фамилия почти наверняка имеет бурятское происхождение. Её носители в основном встречаются в Республике Бурятия, Забайкальском крае и Иркутской области (Усть-Ордынский Бурятский округ). Встречаемость фамилии очень низкая — это не массовая фамилия, а локальная, родовая.

Интересная деталь: в русской записи фамилия могла закрепиться в нескольких вариантах. Встречается написание «Батоширеев» через два «и», но логичнее было бы «Батоширеев» или даже «Батоширяев», если бы имя произносилось с мягким знаком. Однако закрепилось именно такое написание — с «и» в середине, что может говорить о том, что при адаптации бурятского имени в паспортных записях XIX–XX веков звук «эй» записали как русское «ей», а затем отбросили конечный «й», оставив основу «Батоширей». Суффикс -ев добавили по образцу фамилий от имён на -ей (Андрей — Андреев, Матвей — Матвеев).

Сословно предки Батоширеевых, скорее всего, были из простых бурят-скотоводов или казаков. Само имя Батоширей встречается у бурятских лам, но фамилия не обязательно указывает на духовный сан: составные имена с «бато» были популярны у всех слоёв, как пожелание мужественности и твёрдости.