Фамилия Батоева — женская форма фамилии Батоев, и её происхождение напрямую связано с мужским именем или прозвищем Бато. Основа, скорее всего, восходит к бурятскому или монгольскому имени Бато, которое в переводе означает «крепкий», «твердый», «прочный». В тюркских языках тоже встречается схожий корень «батыр» — «богатырь», «герой», но в данном случае форма «Бато» без суффикса -ыр указывает именно на монгольскую языковую среду. Фамилия образована по стандартной русской модели притяжательного суффикса -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного): Бато → Батоев → сын Бато.

Географически фамилия Батоева распространена прежде всего в Бурятии, а также среди калмыков и монгольских народов. В русском контексте она могла возникнуть при крещении или при документальной фиксации бурятских родов в XIX — начале XX века, когда инородцам массово присваивали фамилии по имени отца. Интересная деталь: в отличие от многих русских фамилий на -ов/-ев, которые образованы от полных христианских имен, здесь мы видим светское, дохристианское имя, что говорит о сохранении национальной традиции в основе фамилии.

Версия о происхождении от прозвища Бато («крепкий») выглядит наиболее правдоподобной, так как она напрямую соотносится с семантикой имени и не требует натяжек. Альтернативная гипотеза — связь с диалектным словом «бат» (палка, дубина) — маловероятна: суффикс -о в таком случае нехарактерен для русских прозвищ, а для тюркских и монгольских имен — типичен. Таким образом, предки носительницы фамилии с высокой вероятностью были бурятами или монголами, а сам родоначальник носил имя Бато, что могло указывать на его физическую силу или стойкость характера.