Фамилия Байгузиев — тюркская по происхождению, что сразу заметно по корню «бай» (богатый, господин, хозяин) и суффиксу «-ев», который в русском языке адаптирует нерусскую основу под стандартную модель отчества. Если убрать суффикс, остаётся основа Байгузи. В ней два компонента: «бай» и «гузя» (или «гуза»). Второе слово в разных тюркских языках может означать «глаз», «взгляд», «сторона» или даже «плотина». Поэтому буквальное значение прозвища, лёгшего в фамилию, — «богатый глаз» или «господин взгляда». Скорее всего, так прозвали человека сметливого, зоркого, обладающего особым чутьём — в переносном смысле «видящего насквозь».

Модель образования типична для конца XIX — начала XX века, когда у башкир, татар и других народов Урало-Поволжья начали массово закреплять фамилии по русскому образцу. Исходное имя или прозвище Байгузя (Байгуза) записывали в документах, а затем добавляли «-ев» для сына или потомка. Фамилия Байгузиев почти наверняка имеет башкирские или татарские корни и распространена в основном в Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Встречается и среди казахов, но реже — там фамилия чаще оформлялась бы как Байгузин.

Интересная деталь: в башкирском языке слово «күз» (глаз) в составе сложных имён даёт варианты «гузя» или «гуза» из-за особенностей произношения. Так что Байгузиев — это не просто «сын богатого», а «сын того, у кого богатый глаз». В антропонимике такие прозвища давались не столько по внешности, сколько по характеру или роду занятий: например, пастуху или охотнику, который замечал малейшие следы. Версия о происхождении от арабского «гузи» (воин) менее правдоподобна — в тюркских языках этот корень не даёт устойчивых фамильных форм.

Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к тептярям или башкирам-вотчинникам, но точных данных нет. Фамилия не дворянская и не княжеская — в старых списках служилых татар и башкир она не встречается. Это фамилия крестьянская или казачья, закреплённая в метриках и переписях.