Фамилия Баймакова — одна из тех, где за привычным русским суффиксом -ов скрывается тюркская основа. В большинстве случаев её возводят к мужскому имени Баймак, которое восходит к древнетюркскому корню со значением «богатеющий» или «тот, кто обязательно разбогатеет». Такое имя давали ребёнку как оберег или пожелание: чтобы жизнь сложилась безбедно, чтобы удача в делах сопутствовала с детства.

Но не всё так однозначно. Имя Баймак — не единственный возможный источник. В некоторых говорах, в частности в сергачском диалекте татарского языка, слово «баймак» имеет значение «одинокий человек». Если фамилия пошла от прозвища, а не от имени, то её носитель мог получить такое прозвище за замкнутый, нелюдимый нрав. Есть и совсем бытовая версия: в старину баймаком называли косолапого человека, то есть прозвище могли дать по характерной походке.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Баймаков — сын или потомок Баймака. Женская форма Баймакова закрепилась в документах как стандартное окончание для женщин в русской паспортной системе.

Географически фамилия чаще всего встречается в регионах с компактным проживанием татар и башкир — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Это косвенно подтверждает, что корни у неё тюркские, а не славянские.

Точное время возникновения конкретного рода Баймаковых без генеалогического исследования назвать сложно — фамилия могла оформиться и в XVIII, и в XIX веке, в зависимости от того, когда предки получили паспортные записи. Но сама основа, имя или прозвище, уходит вглубь кочевой культуры, где слово «бай» (богатый, господин) было одним из ключевых в социальной иерархии.