Фамилия Баймишева — женская форма фамилии Баймишев, которая имеет восточные корни и образована от мужского личного имени. Исходное имя — Байтмыш, что в переводе с тюркского означает «ребенок (мальчик), который обогатит кого-либо». Такой моделью родители закладывали в имя пожелание сыну удачи, счастья и безбедной жизни. Со временем имя могло видоизмениться и закрепиться в быту как Баиш, что переводится как «состоятельный, могущественный друг, товарищ, спутник». Обе версии указывают на социально значимые качества: богатство, силу и надёжное окружение.

Словообразовательная модель фамилии типична для русского языка, но основа здесь тюркская. Суффикс -ев (в мужском варианте) и окончание -а (в женском) указывают на принадлежность: «из семьи Баймиша». То есть первоначально Баймишевы — это потомки человека по имени Баймиш или Байтмыш. Такие фамилии были распространены в среде татар, башкир и других тюркоязычных народов, входивших в состав Российской империи, где русская административная система требовала фиксации родовых прозваний.

Точное время возникновения фамилии установить сложно — процесс оформления фамилий у тюркских народов шёл неравномерно и растянулся на несколько столетий. Окончательно говорить о месте и времени происхождения конкретного рода Баймишевых можно только после генеалогических изысканий. Однако сама основа имени указывает на то, что предки носителей фамилии жили в среде, где ценились благосостояние и верное товарищество.