Фамилия Баймурат — наглядный пример того, как тюркское наследие вплелось в русскую фамильную систему. Она образована от составного мужского имени Баймурат, которое на многих тюркских языках (татарском, башкирском, казахском, ногайском) означает «богатая цель» или «богатое желание». Первая часть «бай» переводится как «богатый, знатный», вторая «мурат» — «цель, намерение, желание». В мусульманской среде имя Мурат также ассоциируется с арабским «мурад» — «желанный, вожделенный». Таким образом, имя Баймурат давали с пожеланием богатства и достижения всех целей.

Модель образования фамилии — простейшая: к тюркскому имени добавили нулевой суффикс, то есть фамилия совпала с именем без дополнительных русских окончаний (-ов, -ев, -ин). Это характерно для фамилий, которые фиксировались в документах в период, когда тюркские имена ещё не полностью русифицировались, или для фамилий, сохранившихся в среде, где русский суффикс не прижился. Встречаются и варианты Баймуратов, Баймуратович, но форма Баймурат — более архаичная и указывает на прямое заимствование.

Носители фамилии Баймурат — это, как правило, потомки тюркских народов Поволжья, Приуралья или Северного Кавказа. В России фамилия наиболее распространена среди татар и башкир, реже — у казахов и ногайцев. Встречается она и в Средней Азии, но там чаще сохраняется в виде личного имени. Поскольку фамилия образована от имени, она не несёт указания на конкретное ремесло или сословие предка: её носителем мог быть и знатный бай, и простой крестьянин — имя было популярно в самых разных слоях.

С точки зрения русской ономастики, фамилия Баймурат стоит особняком: она не вписана в типичную для русских фамилий модель с суффиксом принадлежности. Это делает её более «прозрачной» для этимолога, но менее удобной для склонения в русском языке (она не склоняется по падежам, если принадлежит мужчине, и склоняется как существительное женского рода, если женщине). В дореволюционных метрических книгах фамилию могли записывать как Баймуратъ, что подтверждает её позднюю фиксацию в русской графике.