Фамилия Байтуллин происходит от арабского имени Байтулла, что означает «Дом Аллаха». Так называют главную святыню ислама — Каабу, четырёхугольное сооружение в Мекке, где хранится «чёрный камень». Имя Байтулла давали мальчикам в знак глубокой религиозности, как символ близости к вере. Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: Байтуллин — «сын Байтуллы» или «из рода Байтуллы». Такое словообразование характерно для тюркских фамилий, которые складывались в среде татар, башкир и других народов Поволжья и Приуралья в XIX веке, когда мусульманские имена адаптировали под русскую паспортную систему. В отличие от более частых фамилий на -ов, суффикс -ин здесь встречается реже, что делает Байтуллина заметной среди однокоренных вариантов, таких как Байтулов или Байтулин. Регионально фамилия чаще всего встречается у татар и башкир, особенно в Башкортостане и Татарстане, что указывает на возможные корни предков именно в этих областях. Основой фамилии стало не просто имя, а сакральное понятие, поэтому носитель Байтуллин мог происходить из семьи, где чтили исламские традиции, а предок, вероятно, был муллой, учителем или просто верующим человеком, получившим такое имя при рождении.