Фамилия Бекембаева — женская форма фамилии Бекембаев, которая имеет отчетливое тюркское происхождение. Её основа восходит к сложносоставному имени или прозвищу «Бекембай», где «бек» (в разных тюркских языках — «господин», «князь», «вождь») — один из самых распространенных компонентов в именах знати и воинов. Вторая часть, «ембай», скорее всего, является вариантом имени «Эмбай» или «Йембай», где «бай» означает «богач», «хозяин», «господин». Таким образом, Бекембай — это двойной титул, что-то вроде «господин-богач» или «князь-вождь». Подобные имена давали с пожеланием благополучия и высокого статуса.

Фамилия Бекембаева почти наверняка казахская. На это указывает и характерный суффикс -ев/-ева, который в русской передаче закрепился за тюркскими основами, и сама модель имени. В казахской ономастике фамилии на -баев, -баева (от «бай») — одни из самых массовых, но двойной формант «бек+бай» встречается реже, что делает фамилию более узнаваемой. Предки носителей фамилии, вероятно, принадлежали к социальным верхам кочевого общества: либо к родовой знати (бекам), либо к зажиточным скотоводам (баям), либо к воинам, получившим такое имя за заслуги.

Географически фамилия Бекембаева распространена в Казахстане, особенно в южных и западных регионах. Встречается она и среди казахов, живущих в России (в Оренбургской, Астраханской областях, на Алтае), но это уже следствие миграций. Стоит отметить, что в русском языке фамилия склоняется как обычное прилагательное женского рода: Бекембаевой, Бекембаеву.

В отличие от более простых фамилий, образованных от одного корня («Баймуратов»), здесь мы видим двойное усиление статуса. Это говорит о том, что имя-основа было дано человеку, от которого ждали не просто богатства, но и власти, лидерства. И хотя точных сведений о сословном положении первых носителей нет, сама структура фамилии указывает на аристократический или воинский контекст происхождения.