Фамилия Бекеева образована от мужского имени Бекей, которое, скорее всего, является бытовым, упрощённым вариантом татарского имени Биккай. В татарской ономастике имена с основой «бик» (крепкий, сильный) и уменьшительным суффиксом «-ай» — распространённый тип. Именно эта версия выглядит наиболее убедительной, поскольку напрямую объясняет структуру имени без лишних допущений.

Существует и альтернативное объяснение, связывающее фамилию с татарским женским словом «бике» — «госпожа, хозяйка». В этом случае фамилия могла возникнуть как матроним, то есть по имени матери, что для тюркских фамилий встречается реже, но вполне возможно. Однако эта гипотеза слабее: прозвище «Госпожа» скорее дали бы самой женщине, а не её потомкам в мужском роде.

Ещё одна версия отсылает к казахскому мужскому имени Бекен, которое переводят как «сайгак» (степная антилопа). Здесь сомнение вызывает фонетика: переход «Бекен» в «Бекей» неочевиден, хотя в живой речи такое сокращение возможно. Тем не менее, для фамилии Бекеева казахский след менее вероятен, чем татарский, — суффикс «-ев» типичен для русской адаптации именно татарских имён.

Обратите внимание на окончание: фамилия Бекеева — женская форма. Мужской вариант, Бекеев, образован по стандартной модели притяжательного суффикса «-ев», который в русской традиции присоединяли к тюркским основам на согласный. Это указывает на то, что предок носителя фамилии, скорее всего, был крещёным татарином или выходцем из тюркской среды, интегрированным в русское сословие.

Точное время и место возникновения рода Бекеевых без генеалогического исследования не установить. Но сама структура фамилии — редкое сочетание тюркского корня с русским суффиксом — говорит о длительном процессе ассимиляции, когда личное имя Бекей превратилось в наследственное родовое прозвище, а затем закрепилось в документах.