Фамилия Бекиева — женская форма фамилии Бекиев. Её основа восходит к тюркскому слову «бек» (князь, господин, правитель), которое входило в состав многих имен и титулов у народов Средней Азии, Кавказа и Поволжья. Суффикс -ев указывает на патронимическое происхождение: фамилия образована от имени или прозвища предка по мужской линии. В русской традиции фамилии на -ев, как и на -ов, закрепились в XVI–XVII веках, когда фиксировали принадлежность к роду.

Исходное имя Бекий (или Бекей) — это уменьшительно-ласкательная форма от имени Бек. У тюркских народов такие имена давали мальчикам в знак пожелания стать вождем или влиятельным человеком. Встречается вариант Беке — с тем же значением. Фамилия Бекиев/Бекиева могла возникнуть в среде татар, башкир, кумыков, казахов или народов Кавказа. Географически она чаще встречается в Татарстане, Башкортостане, Дагестане, а также в регионах с тюркским населением.

Особенность фамилии в том, что она не содержит характерного для многих тюркских фамилий суффикса -ов/-ев, привязанного к русской модели. Скорее всего, фамилия оформилась уже в рамках русской административной системы, когда инородные имена адаптировали под стандарт «имя + -ов/-ев». В ряде случаев Бекиевы могли быть потомками служилых татар или башкир, которые получали земли и чины в Московском государстве, но точных данных о сословной принадлежности большинства носителей нет.

Встречается также версия, что фамилия восходит к арабскому имени Баки (вечный) через тюркское посредничество, но это менее вероятно: форма Бекиев прямо указывает на корень «бек», а не на арабское «баки». Фамилия Бекиева — редкий пример, где тюркская титульная основа сохранилась в чистом виде, без усложнения дополнительными суффиксами или приставками.