Фамилия Бекиев образована от тюркского имени Бек. В основе лежит древний титул «бек» (в русской передаче также «бей», «бий») — так называли родоплеменного вождя, князя или военачальника. Имена с этим компонентом были чрезвычайно популярны у многих тюркских народов: татар, башкир, казахов, ногайцев, народов Кавказа. Присоединение к имени Бек русского патронимического суффикса -ев (вариант -ов после мягкого согласного) дало фамилию, которая буквально означает «сын Бека» или «потомок Бека». Модель образования типична для фамилий, возникших в среде крещёных татар или других тюркских групп, вошедших в состав Русского государства.

Стоит обратить внимание на конечное -ий. В русском языке фамилии на -ев обычно не имеют окончания -ий (ср. Беков, Бековский). Здесь же мы видим форму Бекиев, которая характерна для фамилий, зафиксированных в среде кавказских народов — осетин, ингушей, чеченцев. У них -иев нередко передаёт тюркское окончание родительного падежа или просто служит русифицированным оформлением местной фамилии. Таким образом, носители фамилии Бекиев с высокой вероятностью имеют северокавказское или кавказско-тюркское происхождение, а не волго-уральское. В осетинском языке, например, фамилии на -иев (от тюркских основ) — обычное явление: Бекиев, Битаров, Тотиев.

Встречается и другой вариант фамилии — Бекиев с ударением на первом слоге, что может указывать на карачаево-балкарские или кумыкские корни. В этих языках имя Бек (или Бекк) является распространённым личным именем, а фамилия образована по той же модели. Спорной можно считать гипотезу о происхождении от русского слова «бекать» (заикаться) — она маловероятна, так как прозвище Бека в русском языке не зафиксировано, а тюркская основа очевидна и подтверждается географией фамилии.

Сословная принадлежность предков Бекиевых могла быть разной. Титул «бек» в прошлом носили не только знатные люди, но и зажиточные крестьяне, старшины родов. Поэтому фамилия не обязательно указывает на аристократическое происхождение — она скорее говорит о том, что предок носителя был уважаемым человеком в своей общине, возможно, старейшиной или воином.