Фамилия Бекишов — один из тех случаев, когда за привычным русским суффиксом -ов скрывается нерусская, скорее всего тюркская, основа. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать имя или прозвище Бекиш, от которого фамилия и образована.

Самая прямая версия: Бекиш — это форма тюркского имени или титула «бек» (князь, господин, предводитель) с уменьшительно-ласкательным суффиксом -иш. В татарском, башкирском, казахском и других тюркских языках такой способ словообразования распространён: от основы «бек» получается имя Бекеш или Бекиш, которое можно перевести как «князёк», «маленький бек» или «сын бека». Это не обязательно указывало на реальное знатное происхождение — часто такие имена давали как пожелание или прозвище.

Менее вероятная, но допустимая версия связывает Бекиша с диалектным русским глаголом «бекать» (заикаться, мямлить) или с детским лепетом. Однако суффикс -иш в русских прозвищах встречается редко (сравните: Гладыш, Малыш), а корень «бек» для тюркского ареала настолько типичен, что первая версия выглядит убедительнее. Если бы фамилия была чисто русской, мы бы скорее увидели вариант Бекалов или Бекин.

Географически фамилия Бекишов распространена в Поволжье, на Урале и в Западной Сибири — в регионах, где исторически жили татары, башкиры и другие тюркские народы, тесно контактировавшие с русскими. Носители фамилии — это, скорее всего, потомки крещёных татар или людей, получивших фамилию по отцу, которого в документах записали как Бекиш. Суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформлена по русской модели «чей?» — то есть сын Бекиша, и это говорит о том, что предок был включён в русскую сословную систему, вероятно, в XVII–XIX веках.

Обратите внимание на однокоренные фамилии: Бекешев, Бекишев, Бикишев. Разница в написании (е/и) — обычное дело при записи тюркских имён на слух русскими писарями. Бекишов могло возникнуть из того же имени Бекеш, но с оглушением или диалектным произношением. В любом случае, корень здесь один — «бек», и фамилия несёт в себе отголосок степной знатной традиции, адаптированной к русской фамильной системе.