Фамилия Бекирева — женская форма фамилии Бекирев, и её разбор стоит начать с мужского варианта, потому что именно в нём кроется основная загадка. Фамилия образована по самой распространённой в русском языке модели: от основы на согласный звук с помощью суффикса -ев. Эта модель типична для фамилий, возникших в среде крестьян и мещан в XVIII–XIX веках. Вопрос в том, что легло в основу — имя или прозвище.

Самая правдоподобная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках, особенно в татарском и башкирском, есть мужское имя Бекир (вариант Бәкер). Оно восходит к арабскому «Бакр» и означает «молодой верблюд» или, в переносном смысле, «юный, молодой». Учитывая, что в Поволжье и на Урале, где фамилии с такими корнями особенно часты, суффикс -ев часто присоединяли к нерусским именам, Бекирев — это типичный вариант «сын Бекира». В русской среде имя могло исказиться в более привычное «Бекир», откуда и пошла фамилия.

Существует и альтернативная, менее распространённая версия: связь с диалектным словом «бекирь» или «бекир». В некоторых говорах русского севера так могли называть нелюдимого, угрюмого человека или, наоборот, шалуна и егозу. Однако эта гипотеза слабая: слово не зафиксировано в авторитетных словарях русских народных говоров как широко употребительное, а значит, основание для массового возникновения фамилии у неё шаткое. Гораздо логичнее предположить, что перед нами русифицированная форма тюркского имени.

Географически фамилия Бекирева (и Бекирев) тяготеет к регионам с сильным татарским и башкирским влиянием. Её много в Ульяновской, Самарской, Оренбургской областях, в Татарстане и Башкортостане. Это косвенно подтверждает версию об имени Бекир: именно в этих краях, при переходе татар и башкир в православие или при активном межэтническом общении, такие фамилии закреплялись документально. Носительница фамилии может с высокой вероятностью обнаружить в своём роду предка, которого звали Бекир — скорее всего, это был крестьянин или мастеровой, получивший фамилию по имени отца.