Фамилия Бекмухаммедов — яркий пример тюрко-персидского именослова, перешедшего в русскую фамильную модель. Её основа — составное мужское имя Бекмухаммед, где первая часть «бек» (тюрк.) означает «господин, князь, предводитель», а вторая — «Мухаммед» (араб., «восхваляемый», имя пророка ислама). Таким образом, имя переводится как «князь Мухаммед» или «господин, подобный Мухаммеду». Фамилию образовали по стандартной русской патронимической схеме: к основе добавили суффикс -ов, который указывает на принадлежность («сын Бекмухаммеда»).

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически сильны тюркские языки и исламская традиция: Казахстан, Узбекистан, Туркменистан, а также северокавказские республики России. В русской среде она закрепилась в советское время, когда у народов Средней Азии и Кавказа активно оформляли фамилии по русскому образцу. В отличие от многих фамилий, образованных от прозвищ или профессий, Бекмухаммедов прямо указывает на имя отца или предка, причём имя это — составное, что характерно для мусульманской ономастики, где уважаемые компоненты (титул + имя пророка) нередко сливались в одно.

Интересная деталь, которую часто упускают: в дореволюционных записях фамилия могла писаться иначе — Бек-Мухаммедов, через дефис, или даже Бекмухамедов, без удвоенной «м». Это связано с тем, что арабское имя Мухаммад в разных тюркских языках передавалось по-разному: в казахском оно звучит как «Мұхаммед», в туркменском — «Мухаммед», в узбекском — «Muhammad». Вариант с одной «м» (Бекмухамедов) встречается реже, но тоже корректен и отражает местное произношение.

В социальном плане фамилия не даёт точной привязки к сословию: «бек» в имени предка мог быть как реальным титулом (например, у знатных родов Хивы или Коканда), так и просто уважительным компонентом, который добавляли к имени в народе. Поэтому носитель фамилии мог быть и потомком местной аристократии, и сыном простого скотовода, которого назвали в честь деда-бека. Различить это без генеалогических изысканий невозможно, но сам факт наличия титульного компонента в имени говорит о том, что предок пользовался авторитетом в своей общине.