Фамилия Бердочкина образована от прозвища Бердочка. По одной из версий, оно ведет свое начало от нарицательного «бердо» со значением «основная рабочая деталь ткацкого станка в виде гребня». Вероятно, это прозвище относится к так называемым «профессиональным» именованиям, указывающим на род деятельности основателя фамилии: он мог быть ткачом. Распространенность профессии ткача во все времена объясняет популярность фамилий, связанных с ней. Менее вероятно, что фамилия Бердочкина имеет арабо-мусульманские корни. Возможно, в основу фамилии Бердочкина легло тюркское имя Берди (точнее, его форма Бердочка), которое означает «он (Бог) дал». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бердочка, со временем получил фамилию Бердочкин.