Фамилия Бердочкина — женская форма фамилии Бердочкин. Её основа, как и в большинстве русских фамилий на -ин, указывает на принадлежность: «чей?» — Бердочкин, то есть сын, потомок или человек из семьи Бердочки. Сама же фамилия Бердочкин образована от прозвища Бердочка.

И здесь есть два основных пути, по которым могло пойти слово. Первый, самый прямой и правдоподобный, ведёт в ткацкую мастерскую. Слово «бердо» — это основная рабочая деталь ткацкого станка, гребень, которым прибивают нить. Прозвище Бердочка могли дать ткачу, причём не просто ремесленнику, а, возможно, мастеру, который делал эти самые гребни или славился особым умением с ними работать. Профессия ткача была повсеместной и древней, поэтому и фамилий, от неё образованных, немало — как прямых (Бердов, Бердочкин), так и косвенных (Ткачёв, Станков). В этом случае фамилия Бердочкина — «профессиональная» по происхождению.

Второй путь — через личное имя. Менее вероятно, но не исключено, что в основе лежит имя Берди (арабо-мусульманского или тюркского происхождения, означающее «он дал», то есть Бог даровал). Уменьшительно-ласкательная форма от него — Бердочка. Тогда фамилия указывает не на ремесло, а на имя предка. Однако для русского уха форма «Бердочка» звучит как типичное прозвище от предмета (сравните: Ложка, Дудка, Гребёнка), поэтому версия с ткацким станком выглядит более естественной и не требует привлечения иноязычных корней.

В любом случае, фамилия Бердочкина — редкая и характерная именно для северных и центральных областей России, где ткачество было одним из главных домашних промыслов. Она не относится к дворянским или купеческим — скорее всего, её носили крестьяне или ремесленники, чей труд был хорошо заметен в общине.