Фамилия Бейсаканов — яркий пример фамилии, образованной от сложного тюркского имени. Её основа — мужское личное имя Бейсакан, которое состоит из двух частей: «бей» (господин, князь, владетель) и «сакан» (от «сак» — «осторожный, бдительный» или «сака» — древнее название скифов). В тюркской ономастике такие двухосновные имена были распространены: первая часть указывала на социальный статус, вторая — на качество или этническую принадлежность. Таким образом, имя Бейсакан могло означать «бдительный господин» или «князь из рода саков».

Фамильный суффикс -ов указывает на русскую адаптацию, характерную для народов, вошедших в состав Российской империи. Фамилии на -ов от тюркских основ массово возникали в XIX — начале XX века при переписях и паспортизации. Бейсаканов — буквально «сын Бейсакана» или «потомок Бейсакана». Аналогичные фамилии (Бейсенов, Бейсембаев) встречаются у казахов, киргизов, каракалпаков, что указывает на географию: скорее всего, корни фамилии лежат в казахской степи или в Приаралье.

Интересно, что фамилия сохранила редкую для русского уха начальную букву «Б» в сочетании «Бей-», что выдаёт её восточное происхождение. В отличие от фамилий с суффиксом -ин (например, Бейсаканин), суффикс -ов — более поздний и «канцелярский», он закрепился в документах при записи на русский лад. Поэтому по фамилии можно предположить, что предок носителя был человеком известным в своём ауле, возможно, старшиной или баем, раз его имя легло в основу фамилии.

Подтвердить этимологию можно через параллели: в казахском языке «бей» — из арабского «бек», а «сақ» — «осторожный, чуткий» (ср. «сақ бол» — «будь осторожен»). Встречается также версия, что «сакан» — это диалектное «сақан» (подбородок), но она менее вероятна: личные имена редко образовывали от частей тела без дополнительного смысла. Так что наиболее правдоподобно толкование через социальный статус и личное качество.