Фамилия Беззубкин образована от прозвища Беззубка, в основе которого лежит прилагательное «беззубый». Первое, что приходит на ум, — указание на внешность: человек мог не иметь зубов или потерять их. Однако в ономастике известна и другая, обереговая, практика: чтобы уберечь ребёнка от злых сил, родители могли намеренно дать ему «плохое» прозвище вроде Беззубки, надеясь, что мальчик вырастет здоровым и с крепкими зубами. Такое имя-оберег закреплялось за человеком в быту и со временем переходило в фамилию.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Беззубкин буквально означает «сын Беззубки». Это одна из типичных моделей русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречаются в центральных и южных регионах, -ин более характерен для северных и северо-восточных земель России, а также для Поволжья. Поэтому географически фамилия Беззубкин может быть привязана к этим областям, хотя точное место требует отдельного исследования.

Редкость фамилии подчёркивает её самобытность. Встречаются однокоренные варианты — Беззубов, Беззубцев, но Беззубкин стоит особняком благодаря прозвищной основе. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные образования рассматриваются как типичные для «прозвищных» фамилий, где основой служит характеристика человека, а не имя или профессия.

Окончательно говорить о времени и месте происхождения фамилии Беззубкин можно лишь на основании генеалогических изысканий, но уже сейчас ясно: она — не просто фиксация внешнего признака, а возможный след древних народных верований и обереговой магии.