Фамилия Бибус — редкая и с неочевидной этимологией. В отличие от большинства русских фамилий, она не оканчивается на -ов, -ин или -ский, что сразу указывает на её нерусское происхождение или на очень старую, сокращённую форму прозвища. Скорее всего, перед нами русифицированная версия немецкой или польской фамилии.

Наиболее правдоподобная версия связывает Бибуса с немецкой фамилией Bibus. В немецком языке это слово — диалектное, южнонемецкое (баварское или австрийское) прозвище для католического священника, что-то вроде «поп» или «батюшка», но с оттенком фамильярности. Происходит оно от латинского bibere («пить»), намекая на известную слабость некоторых служителей церкви. Соответственно, предок-носитель такой фамилии мог быть либо самим священником, либо получить прозвище за характерную внешность или поведение, ассоциируемое с духовным лицом. В России немцев-колонистов часто записывали на слух, и Bibus превращался в Бибуса.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная — польское происхождение. В польском языке есть слово bibuła (промокательная бумага, папиросная бумага), но прозвище Bibus могло образоваться от глагола bibać (диалектное «пить», «выпивать»). Тогда это прозвище пьяницы, гуляки, что семантически пересекается с немецкой версией, но с другим корнем. В любом случае, обе гипотезы сходятся на том, что в основе лежит прозвище, а не крестильное имя.

Суффикса -ус в фамилии нет — это конечная часть корня, которую русское ухо могло воспринять как характерное окончание. Фамилия Бибус не склоняется по падежам как типичная русская, что тоже говорит о её позднем закреплении в документах. Встречается она крайне редко, и географически её следы ведут в Поволжье (бывшие немецкие колонии) и на запад России, куда переселялись поляки и немцы. Сословной принадлежности по фамилии не определить: Бибусами могли быть и крестьяне-колонисты, и мещане, и отставные солдаты.