Фамилия Билибердин — редкий случай, когда основа не даёт однозначного толкования, зато суффикс подсказывает географию. Форма на -ин указывает, что перед нами типичная «малая родина»: так образовывали фамилии в северных и центральных русских говорах, а также в Поволжье. Если бы фамилия была на -ов, её бы связывали с югом или западом России, но Билибердин — скорее северный или волжский след.

Самая правдоподобная версия — прозвище от диалектного глагола «билибердить» (путать, мешать, делать бестолково) или существительного «билиберда» (чепуха, ерунда, бессмыслица). Слово это живёт в народной речи до сих пор, особенно в костромских, вятских и пермских говорах. Прозвище Билиберда могли дать человеку несерьёзному, суетливому или, наоборот, тому, кто любил говорить заумно, но непонятно. Второй вариант — ироничное прозвище болтуна, «пустомели».

Менее вероятна связь с тюркскими корнями (например, «биль» — знание, «бер» — дающий), но для русского прозвища с явным суффиксом -ерд- это натяжка. В русских говорах суффикс -ерд- (как в «шалберда», «кутерьма») как раз характерен для экспрессивных, звукоподражательных и оценочных слов.

По переписям XIX века единичные носители фамилии Билибердин фиксируются в Вятской и Пермской губерниях — это совпадает с ареалом диалектного слова. Значит, предок скорее всего был крестьянином или мещанином, получившим прозвище за характер или манеру речи. Фамилия редкая и, в отличие от массовых Ивановых и Кузнецовых, не успела «стереться» до безликой формы — она до сих пор несёт отпечаток живой народной речи.