Фамилия Блаховитин — редкий случай, когда суффикс сразу указывает на географию и социальный слой. Окончание «-ин» в русских фамилиях обычно крепится к основам на -а/-я (Пушкин, Ильин), но здесь оно добавлено к основе, которая сама по себе не является личным именем или прозвищем в чистом виде. Всё дело в том, что перед нами не просто отчество, а вторичная фамилия, образованная от прозвищной фамилии Блаховита или Блаховитого.

Основа «Блах-» — это искажённое или диалектное произношение слова «блоха». В южнорусских и украинских говорах «блоха» могла звучать как «блаха», а человек, которого дразнили за мелкое телосложение, суетливость или нечистоплотность, получал прозвище Блаха. Далее к нему добавился суффикс «-овит-», характерный для притяжательных прилагательных в украинской и белорусской традиции (сравните: Блаховит — «блошиный», «принадлежащий Блахе»). Такая модель образования — от прозвища через притяжательное прилагательное с последующей русификацией окончания — встречается нечасто и выдаёт в носителе потомка выходцев с территории современной Украины или юга России.

Версия о связи с польским или чешским словом «blach» (жесть, листовое железо) менее вероятна: в этом случае фамилия скорее писалась бы как Бляховитин или Блаховский, а суффикс «-ит-» здесь выглядит чужеродным. Скорее всего, перед нами результат адаптации украинской фамилии Блаховит (или Блаховіт) под русскую патронимическую норму на «-ин». Это типичный случай, когда переселенец из Малороссии получал в документах «обрусевшее» окончание, чтобы фамилия звучала привычно для писцов великорусских губерний.

Сословная принадлежность предков Блаховитиных, вероятнее всего, крестьянская или казацкая. Фамилии, образованные от прозвищ, связанных с бытовыми реалиями или насекомыми, редко встречались у дворянства. В ревизских сказках и метрических книгах XIX века такую фамилию можно найти в южных уездах Воронежской, Курской, Харьковской губерний, а также среди казаков Кубани и Дона. Если ваш предок носил эту фамилию, он почти наверняка происходил из среды однодворцев или казаков, говоривших на смеси русского и украинского говоров.