Фамилия Бобомуратов — характерный пример восточной модели образования фамилий на -ов, которая в XX веке закрепилась у многих народов Средней Азии. В её основе лежит сложное имя Бобомурат, распространённое среди узбеков, таджиков, туркмен и каракалпаков. Первая часть, «Бобо», восходит к тюркскому «баба» — отец, дед, почтенный старец, а в персидском контексте — духовный наставник, святой. Вторая часть, «Мурат» (араб. Мурад), означает «желанный», «цель», «стремление». Таким образом, полное имя Бобомурат можно перевести как «желанный дед» или «цель почтенного старца», что отражает традицию давать ребёнку имя в честь уважаемого предка или в надежде на его покровительство.

Словообразовательная модель здесь проста: к личному имени Бобомурат добавили русский патронимический суффикс -ов, который в советское время стал стандартным для оформления фамилий у многих народов СССР. Это отличает фамилию от исконно славянских, где -ов указывает на принадлежность отцу (чей сын?). В данном случае суффикс механически закрепил имя как наследственную фамилию, не меняя его смысла. Редкость фамилии в том, что она сохраняет полную форму сложного имени без усечения или адаптации, что бывает не всегда — например, параллельно существуют фамилии Бобомурадов (с тем же корнем, но другим вариантом транслитерации) и просто Муратов.

Географически фамилия Бобомуратов тесно привязана к Узбекистану, особенно к Хорезмской области и Каракалпакстану, где имя Бобомурат традиционно популярно. Встречается она и в Туркменистане, но реже. Социальный контекст её появления — послереволюционная паспортизация 1920–1930-х годов, когда многие узбеки и таджики, не имевшие наследственных фамилий, получали их по отцовскому имени. Поэтому предок-носитель фамилии, скорее всего, был простым крестьянином или ремесленником, а его отца или деда звали Бобомурат. Дворянских корней у фамилии нет, как и у подавляющего большинства восточных фамилий, оформленных по русскому образцу.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, Бобомуратов стоит особняком. Фамилия Бабамуратов (с вариантом написания через «а») встречается чаще — она более универсальна для тюркских языков. А вот форма «Бобо-» с ударением на первый слог характерна именно для огузской группы (туркменский) и южных диалектов узбекского языка. Это делает фамилию Бобомуратов своеобразным маркером: носитель, скорее всего, происходит из региона, где говорят на хорезмском диалекте узбекского или близком к нему туркменском наречии.