Фамилия Бобженко звучит на первый взгляд загадочно, но её разбор укладывается в несколько прозрачных линий. Это типичная украинская фамилия с суффиксом -енко, который в украинской ономастике означает «сын» или «потомок». Основа здесь — Бобж-.

Самая вероятная версия: Бобженко — это вариант фамилии Бабженко или Бобченко, где корень восходит к прозвищу Бобжа. В свою очередь, Бобжа — это производное от слова «боб», то есть бобовое растение. В славянской традиции прозвища, образованные от названий растений, давали либо по роду занятий (крестьянин, сеявший бобы), либо по внешним чертам (невысокий, плотный, округлый человек — «как боб»). Суффикс -ж- в основе мог возникнуть как диалектное смягчение или под влиянием польского языка, где «bób» (боб) даёт уменьшительные формы вроде Bobżek.

Вторая, менее распространённая версия, связывает фамилию с личным именем Боб, которое в некоторых регионах считалось сокращением от Богдан или Борис. Тогда Бобжа — это ласкательная форма имени, а Бобженко — «сын Бобжи». Однако эта гипотеза слабее, так как форма Бобжа не фиксируется в исторических источниках как самостоятельное имя.

Географически фамилия Бобженко тяготеет к западным и центральным областям Украины, где суффикс -енко особенно распространён. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении — возможно, от конкретного прозвища в одном селе или роде. Сословно предки Бобженко могли быть крестьянами или казаками: в среде казачества прозвища от растений и животных были обычным делом.

Словообразовательная модель проста: корень Бобж- + суффикс -енко. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Бобже́нко. В русском языке фамилия могла подвергнуться адаптации, но сохранила исходную украинскую форму.