Фамилия Бодндаренко — один из тех случаев, когда орфографическая ошибка или диалектное произношение закрепились в официальном документе. Правильная и самая распространённая форма — Бондаренко, от слова «бондарь» (бочар, ремесленник, делавший бочки). В украинской традиции суффикс -енко означает «сын» или «потомок», то есть Бондаренко — «сын бондаря». Вариант Бодндаренко с двойным «д» возникает из-за ассимиляции: сочетание «нд» в живой речи произносится как «нн» или «ндд», а на письме это иногда отражают как «Бодндаренко». Встречается такой вариант реже, в основном в южных и центральных регионах России, куда фамилия попала с украинскими переселенцами.

Если отбросить орфографическую путаницу, основа фамилии — «бондарь». Это одно из самых распространённых прозвищ по ремеслу на Украине и юге России. Бондари были нужны везде: в сёлах — для хранения зерна и воды, в винокурнях — для бочек под спирт, на ярмарках — для перевозки товаров. Поэтому фамилия Бондаренко (и её искажённая форма Бодндаренко) не указывает на знатность, а говорит о конкретном и уважаемом занятии предка.

Словообразовательная модель проста: корень «бонд-» (от «бондарь»), суффикс -енко. В украинской ономастике этот суффикс — самый характерный маркер фамилий, возникших в XVI–XVII веках, когда патронимическая система (называние по отцу) стала вытеснять прозвища. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые часто закреплялись за крестьянами после отмены крепостного права, украинские фамилии на -енко фиксировались в реестрах казаков и мещан уже в XVII веке.

С точки зрения географии, Бодндаренко (именно с таким написанием) — редкий вариант. Его можно встретить в документах из Курской, Белгородской, Воронежской областей, где исторически было много украинских переселенцев, а грамотность в XIX веке была невысокой. Писарь мог записать фамилию на слух, и двойное «д» стало ошибкой, которая передалась по наследству. В самой Украине форма Бодндаренко почти не встречается — там пишут Бондаренко.

Итак, если ваша фамилия Бодндаренко, вы, скорее всего, потомок украинского или южнорусского бондаря, а двойное «д» в середине — не более чем исторический курьёз записи, который не меняет ни происхождения, ни значения.