Фамилия Бодункова — женская форма фамилии Бодунков, и её ключ к разгадке лежит в основе «Бодунк-». Сразу бросается в глаза суффикс -ун-, который в русской антропонимии часто указывает на прозвище по действию или характерному признаку. Сравните: говорун, ворчун, бегун. В нашем случае основа, скорее всего, связана с глаголом «бодать» — то есть бодаться, толкать рогами. «Бодун» в диалектах — это не только тот, кто бодается (например, упрямый бык), но и драчливый, задиристый человек. Прозвище Бодун мог получить драчун или просто человек с тяжелым, упрямым характером.

Словообразовательная цепочка проста: прозвище Бодун → отчество-притяжательность «Бодунков» (чей? — сын Бодуна) → фамилия Бодунков. Суффикс -ов- здесь типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ или имен, оканчивающихся на твердый согласный. Фамилия сравнительно редкая, что говорит о её локальном происхождении. Встречается она преимущественно в центральных и южных областях России, где был распространен диалектный глагол «бодать» и его производные.

Интересная деталь: не стоит путать эту фамилию с Бодягиными или Бодалёвыми. У «Бодункова» более грубая, «животная» образность — прозвище могло относиться не только к человеку, но и к скотине. В старину, если корова или коза постоянно бодалась, её так и звали — Бодунка. Фамилия могла закрепиться за хозяином такого животного или за целым родом, где держали «бодучий» скот. Альтернативная, менее вероятная версия — связь с диалектным «бодун» в значении «толстяк» или «пузан» (от «бодать» в смысле «выпячивать живот»), но она не имеет широкой поддержки в ономастике. В любом случае, предок носительницы этой фамилии был человеком с яркой, запоминающейся чертой — либо характером, либо родом занятий, либо внешностью.