Фамилия Богдановичь образована от мужского крестильного имени Богдан, которое пришло в русский язык из Болгарии и переводится как «данный богом». Суффикс -овичь (с мягким знаком на конце) указывает на патронимическое происхождение: фамилия буквально означала «сын Богдана». Такая модель была характерна для восточнославянских земель, особенно для юго-западных регионов — современной Украины и Беларуси, где окончание -ич/-ович закрепилось в фамилиях гораздо шире, чем в Великороссии.

В отличие от более привычной русской формы Богданов, вариант с суффиксом -овичь встречается реже и часто указывает на польское или малороссийское влияние. В Речи Посполитой такие фамилии носили не только крестьяне, но и шляхта, что делает социальный слой предков Богдановичей неоднородным: от казацкой старшины до мещан.

Само имя Богдан долго оставалось некалендарным — его не было в святцах, поэтому им часто нарекали ребёнка, рождённого «от бога», то есть как бы вымоленного или долгожданного. В некоторых случаях это имя давали вместо крестильного, если ребёнок был слаб здоровьем, веря, что божественный дар укрепит его. Мягкий знак на конце фамилии — особенность дореволюционной орфографии, которая сохранилась в отдельных ветвях рода, особенно в эмигрантской среде.

Среди однокоренных фамилий — Богданов, Богдан, Богданевич, Богданский. Форма Богдановичь стоит ближе к белорусской и украинской традиции, где патронимические суффиксы нередко писались с мягким знаком.