Фамилия Богдан — одна из тех, где имя и фамилия совпали по форме, без добавочных суффиксов вроде -ов или -ин. Это так называемая «окаменевшая» форма крестильного имени, которая закрепилась за родом без изменений. В русской традиции такие фамилии чаще встречались у выходцев из южных и западных земель — Украины, Белоруссии, Польши, а также у духовенства, где нередко давали «говорящие» семинарские фамилии.

Само имя Богдан — славянский перевод греческих имён Феодот, Феодор и Иоанн, которые значат «данный богом» или «божий дар». На Русь оно пришло из Болгарии вместе с христианством, но быстро стало восприниматься как народное, а не церковное. Поэтому в святцах его не было, и крестили мальчиков под другими именами — чаще всего под именем Феодот Кесарийский, который, по преданию, сам до крещения звался Богданом. Имя жило в быту, но не в официальных церковных записях, что и объясняет его относительную редкость в старых документах.

В XIX — начале XX века фамилия Богдан фиксируется в разных сословиях. Например, в Книге памяти Томской области записан Богдан Кондрат Анисимович, родившийся в 1886 году в селе Черниговка Дальне-Восточного края. А в Книге памяти Омской области отмечен украинец Богдан Павел Никитич, 1902 года рождения, из Полтавской губернии, Хорольского уезда, хутора Козули. Оба примера показывают, что носители фамилии были крестьянами, переселенцами, и что фамилия бытовала не только в великорусских, но и в украинских землях.

Любопытная деталь: в Польше и Болгарии имя Богдан остаётся популярным до сих пор, тогда как в России оно почти вышло из употребления после XVII века. Это делает фамилию Богдан своеобразным маркером — по ней можно предполагать западнославянские или южнославянские корни рода, либо связь с украинской традицией, где имя никогда не уходило из обихода.