Фамилия Бохолдаева — женская форма, мужской вариант — Бохолдаев. Это довольно редкая фамилия, которая почти наверняка имеет тюркские корни, что выдает характерное звучание основы. Скорее всего, в её основе лежит личное имя или прозвище Бохолдай, которое, в свою очередь, образовано от двух тюркских слов: «бок» (крепкий, сильный) и «олда» (владение, страна) или «алда» (перед, впереди). Таким образом, имя могло означать «крепкий (сильный) владыка» или «передовой, первый». В тюркской ономастике такие составные имена с пожеланием силы и власти были распространены.

Суффикс «-ев» указывает на принадлежность: Бохолдаев — буквально «сын Бохолдая», «из рода Бохолдая». Это стандартная модель образования русских фамилий от иноязычных имен в XVI–XIX веках, когда представители тюркских народов (татары, башкиры, ногайцы) входили в состав Российского государства и получали фамилии по отцу по русскому образцу.

География фамилии сегодня неширокая. Основные очаги — Оренбургская область, Башкортостан, Татарстан, а также соседние регионы Урала и Поволжья. Это подтверждает гипотезу о тюркском происхождении. Встречается вариант написания с «а» на конце — Бохолдаева, что является чисто грамматическим родовым окончанием.

Примечательная деталь: в отличие от многих фамилий на «-ев», образованных от профессий или бытовых прозвищ, Бохолдаев явно восходит к личному имени с высоким социальным статусом. Это значит, что предок-основатель мог быть не простым крестьянином, а, например, мелким татарским мурзой, старшиной или воином, чье имя-прозвище закрепилось за его потомками. В документах XIX века такие фамилии нередко носили отставные казаки или тептяри (сословие, близкое к башкирам и татарам), что также указывает на возможную военно-служилую историю рода.