Фамилия Бокунова — женская форма фамилии Бокунов, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем Бокун. Основа здесь — корень «бок-», который в русских говорах имел несколько значений. Самое очевидное — человек с заметным боком, полный или широкоплечий, но есть и более узкое, диалектное толкование: в некоторых областях «бокун» называли упрямого, своенравного человека, который «ходит боком», то есть делает всё наперекор. Иногда так могли прозвать и того, кто жил на отшибе, «с боку» от основной деревни.

Суффикс «-ун» в русском языке активно использовался для образования прозвищ по характерному действию или признаку (ср. «говорун», «крикун», «бегун»). «Бокун» — типичная модель для человека с ярко выраженной чертой: или физической (широкий, косой), или поведенческой (упрямый, нелюдимый). Менее вероятно, но не исключено, что в основе лежит тюркское слово «бок» (грязь, нечистоты) — тогда прозвище могло относиться к неопрятному человеку, но для русской фамилии этот вариант маргинален.

С точки зрения географии, фамилия Бокуновы встречается в основном в центральных и южных регионах России, особенно в Воронежской, Ростовской областях и на Кубани. Это указывает на её позднее оформление в крестьянской среде, где прозвища давали по бытовым признакам, а не по ремеслу или отчеству. В дворянских родословных книгах эта фамилия не значится — её носители, скорее всего, были однодворцами или государственными крестьянами, то есть людьми, которые не знали крепостной зависимости и могли свободно менять место жительства.

Интересная деталь: в некоторых старых документах XVIII века встречается написание «Бакунов» — с буквой «а» в первом слоге. Это не ошибка, а следствие акающего произношения, которое в южнорусских говорах было нормой. Со временем написание закрепилось в литературной форме через «о», но в устной речи до сих пор можно услышать оба варианта. Таким образом, Бокунова — это фамилия-прозвище, которая говорит о внешности или характере предка, а не о его профессии или месте жительства.