Фамилия Бомберук представляет собой фонетический вариант фамилии Бамберук, которое восходит к немецкому имени Бамбер. На русский язык оно переводится как «ствол дерева». По другой версии, основой фамилии Бамберук послужило прозвище Бамбер, которое ведет свое начало от аналогичного нарицательного». В переводе с немецкого языка оно означает «короткий». Возможно, что это прозвище отражало особенности телосложения предка. Так, наличие в фамилии Бомберук суффикса -ук указывает на то, что она сформировалась под славянским влиянием и принадлежит еврейскому роду, основатель которого проживал на территории Украины.