Фамилия Боржанов образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Боржана). Основа здесь — прозвище или некалендарное имя Боржан. В отличие от более частых фамилий на -анов (Султанов, Хасанов), корень Борж- встречается редко, и его происхождение стоит разобрать отдельно.

Скорее всего, в основе лежит тюркское или кавказское слово «борж» — в ряде тюркских языков это «долг», «обязательство», «заём». В таком случае Боржан — человек, который брал или давал в долг, возможно, ростовщик или просто тот, с кем у односельчан были денежные отношения. Вторая версия связывает прозвище с грузинским «бордж» (борьба, битва) — тогда Боржаном могли прозвать драчуна или воина. Третий, менее вероятный вариант — искажённое Буржан, от арабского «бурж» (башня, крепость), но в русских документах такая замена гласных редка.

Суффикс -ан в основе (Боржан) типичен для тюркских имён и прозвищ, которые часто оканчивались на -ан: Айхан, Темиржан. В русскую среду фамилия попала, скорее всего, из среды служилых татар или выходцев с Северного Кавказа, которые принимали православие и получали фамилии по отцу. Географически Боржановы встречаются в Поволжье, на Урале и в Западной Сибири — регионах, где традиционно жили тюркоязычные народы.

Словообразовательно фамилия стоит в одном ряду с Боржоновым (вариант написания через «о») или Боржановским, но последняя форма — явно более поздняя, дворянская или польская, в то время как Боржанов — фамилия крестьянская или мещанская, без приставок и усложнений. В дореволюционных метриках она могла записываться как Баржанов (с аканьем), но корень оставался тем же.