Фамилия Бошканец — редкий случай, когда географический суффикс «-ец» указывает не на славянское, а на балканское происхождение основы. В русском языке «-ец» обычно обозначает выходца из места (Рязанец, Томец), но здесь он закрепился за словом, пришедшим из молдавского или румынского языка. Основа «бошкан» восходит к румынскому «boșcan» — так называли бочку, кадку для вина или солений. Прозвище Бошкан мог получить бондарь, делавший такие бочки, или человек плотного, «бочкообразного» телосложения.

Самый вероятный путь фамилии — через Бессарабию, где столетиями жили молдаване, украинцы и русские. Суффикс «-ец» мог появиться уже на восточнославянской почве: переселенца из молдавского села, где жили Бошканы, называли Бошканец — «тот, кто из семьи Бошканов». В украинских говорах встречается и вариант Бошканець, что подтверждает юго-западный ареал фамилии.

Словообразовательная модель здесь двойная. Если фамилия складывалась в русской среде, то «-ец» — это патронимический или локативный суффикс. Если же она оформилась в молдавской, то «-ец» мог быть русской адаптацией румынского суффикса «-eanu» (Бошканеану → Бошканец). Вторую версию поддерживает то, что в Молдове и Румынии действительно встречается фамилия Boșcan, а Boșcăneț — её вариант.

В дореволюционных списках фамилия почти не фиксируется — это говорит о её позднем письменном закреплении, вероятно, уже в XX веке. Носители Бошканец живут в основном на юге Украины (Одесская, Николаевская области), в Приднестровье и на юго-западе России. Встречаемость крайне низкая: по открытым данным, в России фамилию носят не более нескольких сотен человек.

Известных исторических деятелей с такой фамилией нет — это типичная фамилия сельских ремесленников и крестьян, не попавшая в дворянские родословные книги. Зато она сохранила прямую связь с конкретным ремеслом: предки Бошканцев почти наверняка делали бочки для вина, которое веками производили в бессарабских селах.