Фамилия Ботикова — женская форма фамилии Ботиков, а та, в свою очередь, образована от прозвища Ботик. Обычно прозвища давали по занятию человека, и здесь есть несколько версий, каждая из которых рисует портрет возможного предка.

Наиболее прямая версия связывает прозвище с морским делом. Слово «бот» в русском языке издавна означало небольшое одномачтовое судно, чаще плоскодонное, пригодное для перевозки грузов по рекам и вдоль побережья. Ботиком могли прозвать судостроителя, лодочника или моряка — того, кто имел дело с такими судами. В пользу этой версии говорит и то, что суффикс -ик- в прозвище указывает на уменьшительную форму: «маленький бот» или «человек, связанный с ботом».

Другая, не менее логичная версия, отталкивается от слова «боты» — высокой обуви, калош или ботинок. В этом случае прозвище Ботик получал сапожник или торговец обувью. Такие «профессиональные» прозвища по предмету труда — обычное дело в русской ономастике.

Есть и третья, более редкая гипотеза, которая выводит прозвище от слова «ботало». Так называли шест с дощечкой или деревянным колокольчиком на конце — им загоняли рыбу в сети или вешали на шею скотине вместо колокольчика. Если следовать этой версии, Ботиком могли называть рыбака, пастуха или скотовода. Однако эта версия менее убедительна: звуковой переход «ботало → Ботик» неочевиден, и маловероятно, чтобы человека прозвали по орудию труда, а не по самому занятию.

Словообразовательная модель фамилии проста: суффикс -ов- указывает на принадлежность («сын Ботика»). Фамилия Ботикова, как и большинство русских фамилий на -ов/-ев, закрепилась в северных и центральных регионах России, где были развиты ремёсла и судоходство. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении: скорее всего, в основе лежит конкретное прозвище одного человека, а не массовое именование по профессии.