Фамилия Ботуновы образована от прозвища Ботун. Это слово в русских говорах неоднозначно, и каждая из его трактовок ведёт к разным занятиям предков. Основное диалектное значение — «зелень, ствол и листья всех травянистых растений, особенно корнеплодных». Если прозвище дали по этому смыслу, перед нами «профессиональное» именование: Ботуном могли называть огородника, который выращивал овощи на продажу, или зеленщика, торговавшего съедобной ботвой.

Однако есть и более узкое, локальное значение. В костромских говорах ботуном называли перегодовалый, а иногда и стрельчатый лук — тот, что пошёл в стрелку и уже не годится в пищу, но идёт на семена. В этом случае прозвище мог получить человек, специализировавшийся на выращивании лука-севка или лука на семена, то есть работавший с «ботвой» лука. Получается, что основатель рода Ботуновых мог быть как обычным огородником, так и узким специалистом по луку.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Ботунов — это сын или потомок Ботуна. Фамилия эта — не дворянская и не княжеская, а крестьянская или посадская, возникшая в среде, где прозвища давали по занятию или по заметной черте. Точное место и время появления фамилии установить трудно: процесс её закрепления шёл несколько столетий, и Ботуновы могли независимо друг от друга появиться в разных регионах, особенно в северных и центральных губерниях, где были развиты огородничество и торговля зеленью.

В ономастических справочниках фамилия Ботунов встречается редко, что говорит о её сравнительной немногочисленности. Это не «массовая» фамилия вроде Ивановых или Кузнецовых, а скорее локальная, связанная с определённой хозяйственной нишей. Если вы носите эту фамилию, ваши предки с высокой вероятностью были крестьянами или мещанами, кормившимися с земли и рынка.