Фамилия Ботыгин имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Ботыгин уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Ботыгин являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Вероятно, фамилия Ботыгин образована от имени Ботыга (другие варианты — Батыга и Бутыга, Ботуга), которое представляет собой адаптированное русскими восточное имя Батый. Это имя имеет монгольское происхождение и переводится на русский язык как «драгоценный камень». По мнению Н.А. Баскакова, в основе имени Батый лежит монгольское слово «бата», означающее «крепкий, здоровый; надежный, постоянный». В русском языке имя Батый перешло в разряд нарицательных существительных в значении «плохой, злой; разоритель». Вероятно, это связано с великими походами хана Батыя и его многочисленными завоеваниями. Поэтому не исключено, что в основе фамилии Ботыгин лежит не имя, а прозвище Ботыга, которое мог получить деспотичный, властный человек, стремящийся подчинить своей воле окружающих. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Ботыгин способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Ботыгин представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.