Вероятно, фамилия Ботыгин образована от имени Ботыга (другие варианты — Батыга и Бутыга, Ботуга), которое представляет собой адаптированное русскими восточное имя Батый. Это имя имеет монгольское происхождение и переводится на русский язык как «драгоценный камень». По мнению Н.А. Баскакова, в основе имени Батый лежит монгольское слово «бата», означающее «крепкий, здоровый; надежный, постоянный». В русском языке имя Батый перешло в разряд нарицательных существительных в значении «плохой, злой; разоритель». Вероятно, это связано с великими походами хана Батыя и его многочисленными завоеваниями. Поэтому не исключено, что в основе фамилии Ботыгин лежит не имя, а прозвище Ботыга, которое мог получить деспотичный, властный человек, стремящийся подчинить своей воле окружающих.