Фамилия Боймер — редкий для России пример фамилии немецкого происхождения. Она образована от прозвища, которое, согласно одной из версий, восходит к средневерхненемецкому слову boum — «дерево». Скорее всего, такое прозвище дали человеку по месту жительства: около большого дерева или на опушке леса. Не исключено, что оно могло описывать и внешность предка, например, его высокий рост — «дерево» как метафора.

Однако есть и другая, не менее правдоподобная версия. Корень может происходить от средненижненемецкого bōm, что означало «барьер» или «граница». В этом случае прозвище Боймер относилось к «профессиональным» именованиям: так могли назвать человека, работавшего на таможне или отвечавшего за пограничный пост. Модель образования фамилии типична для немецких фамилий на -er, которые часто указывают на жителя определённой местности или на профессию (сравните с Bäumer — «лесник» или «дровосек»).

В России фамилия Боймер встречается нечасто и концентрируется в регионах, куда в XVIII–XIX веках приглашали немецких колонистов: Поволжье, Западная Сибирь, Санкт-Петербургская губерния. Если ваши предки носили эту фамилию, они с высокой вероятностью были либо выходцами из немецких земель, либо их потомками, сохранившими исходное родовое прозвище. Окончание -ер указывает на то, что фамилия не русифицировалась и не получила типичных славянских суффиксов -ов или -ин, что само по себе — важная подсказка для генеалогического поиска.