Фамилия Божинецкая — женская форма фамилии Божинецкий, и её происхождение напрямую связано с польской и западнорусской ономастической традицией. Ключевой элемент здесь — суффикс -ецк-/-цк-, который в польском языке даёт окончание -ski, а в русской адаптации превращается в -ский/-цкий. Такие фамилии в XVI–XVII веках чаще всего носили представители шляхты или людей, владевших землёй, но со временем они распространились и среди духовенства, мещан и крестьян западных губерний Российской империи.

Основа фамилии — Божин-. Скорее всего, она восходит к личному имени Божа (уменьшительное от Богдан, Божидар или реже — от Борис) или к прозвищу Божина, которое могли дать человеку набожному, «божьему», либо тому, кто родился в религиозный праздник. В польском языке слово boży означает «божий», а суффикс -ina типичен для образования притяжательных форм. Таким образом, Божинецкий — это «тот, кто из поместья или рода Божины».

Географически фамилия привязана к территории бывшей Речи Посполитой: современные Польша, Беларусь, Западная Украина и Литва. Поскольку фамилия оканчивается на -цкая, а не на -ская, это указывает на польское произношение или на запись в православных метрических книгах, где польские «sz» передавали через «ц». Встречаются варианты написания: Божинецка, Божынецкая, Боженецкая.

В отличие от фамилий на -ов/-ев или -ин, которые образуются от имени отца (сын Ивана — Иванов), фамилии на -ский/-цкий часто указывают на владельческую или топонимическую связь. Если бы существовало село Божино или Божинец, то выходец оттуда и получил бы прозвище Божинецкий. Такие названия действительно встречаются в Польше (например, Божин под Варшавой), что делает версию с географическим корнем наиболее правдоподобной.

Сословно носительницы фамилии Божинецкая в XIX веке могли быть как из обедневшей шляхты, так и из крестьян, получивших фамилию по месту жительства. В советское время окончание -цкая нередко упрощали до -цка, но в документах сохранялась полная форма. Сегодня это редкая фамилия, и её обладательницы, скорее всего, имеют корни в западных областях Украины или Беларуси.