Фамилия Браковенко — редкий случай, когда основа настолько прозрачна, что бросается в глаза, но при этом неочевидна по смыслу. Суффикс -енко указывает на украинское происхождение: так в XVI–XVII веках на Левобережной и Слободской Украине образовывали фамилии по модели «сын такого-то». Браковенко — буквально «сын Брака», где Брак — не фамилия, а прозвище или мирское имя отца.

Корень «брак» здесь двоякий. Первая и самая вероятная версия — от слова «брак» в значении «супружество». В старой Украине прозвище Брак могли дать женатому мужчине, особенно если он долго ходил в холостяках и наконец остепенился. Вторая версия — от глагола «браковать» (от нем. brack — «негодный»), то есть отбрасывать плохое. В ремесленной среде Браком называли мастера, который проверял качество товара, или придирчивого человека. Однако для украинской ономастики семья «брак-женитьба» встречается чаще, чем «брак-недостаток».

Любопытно, что фамилия Браковенко практически не встречается в центральных и западных областях Украины, где преобладают фамилии на -ук, -юк или -ский. Её ареал — юго-восток: Запорожская, Днепропетровская, Донецкая области. Это зона позднего заселения в XVIII–XIX веках, куда переселялись казаки и крестьяне из Полтавщины и Черниговщины. Возможно, предки Браковенко были из числа запорожских казаков: прозвища у них часто давались по бытовым приметам, а не по сословному статусу.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает украинскую модель: Браковский (полонизированный вариант с -ский), Браков (русская адаптация с -ов), Брачук (с западноукраинским суффиксом). Браковенко — самая «чистая» форма от прозвища без дополнительных географических или сословных наслоений. Никаких свидетельств о дворянском происхождении этой фамилии нет: в родословных книгах Российской империи она не значится, что типично для казацко-крестьянской среды.

По данным переписей XIX века, носители фамилии Браковенко были преимущественно государственными крестьянами и мещанами. Никаких выдающихся исторических личностей с такой фамилией не зафиксировано — это «тихая» фамилия, которая говорит о простом происхождении и, скорее всего, о семейной истории, связанной с женитьбой или ремеслом.