Фамилия Браковина — женская форма, но её основа восходит к мужскому прозвищу Бракова или Браковина, которое, скорее всего, связано с браком. В русской ономастике слово «брак» имело два значения: неудачное, испорченное изделие и супружество. Какое из них легло в основу фамилии — вопрос неочевидный.

Если отталкиваться от ремесленной версии, прозвище Брак мог получить человек, работавший с бракованным товаром — например, браковщик на мануфактуре или торговец, скупавший некондицию. Такое прозвище не обязательно несло негативный оттенок: в среде ремесленников и купцов «брак» был конкретным термином, а не оскорблением. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Браковина — «жена Брака» или «дочь Брака». В русских фамилиях эта модель типична для прозвищ на -а, -о: Брако → Браков, Браковин.

Менее вероятна, но возможна связь со словом «брак» в значении «супружество». Тогда прозвище Брак могли дать человеку, который прославился свадьбой, многожёнством или, наоборот, холостяцким положением. Однако в русской традиции прозвища от семейного статуса обычно образовывались иначе (Женатый, Холостяк), так что эта версия слабее.

Географически фамилия редкая и не привязана к одному региону — встречается в центральных областях России, а также у потомков переселенцев на Урале. В дореволюционных источниках носители Браковиных фиксировались среди крестьян и мещан, что неудивительно: прозвища от профессий и ремесёл были распространены в низших сословиях.

Однокоренные фамилии — Браков, Браковский, Бракевич — различаются суффиксами и регионами бытования. Браковина стоит особняком из-за окончания -ина, которое часто указывает на женскую линию, но в качестве фамилии закрепилось в неизменной форме. Есть ещё вариант Браковин — без конечного -а, но это уже другая фамилия, хоть и от того же корня.