Фамилия Буенков — яркий пример того, как прозвище, данное за характер, закрепилось в родовом имени. В её основе лежит прилагательное «буйный» в его старой, краткой форме — «буен». В древнерусском языке слово «буй» означало не только «дерзкий, смелый», но и «сильный, могучий, быстрый». Прозвище Буен мог получить человек вспыльчивый, неуемный в гневе или веселье, либо, напротив, обладающий недюжинной физической силой и удалью.

Модель образования проста и типична для центральной России: к основе «Буен» добавился патронимический суффикс -к- (указывающий на принадлежность, как в именах Ивашка, Петька), а затем фамильный суффикс -ов. Таким образом, Буенков буквально означает «сын (или потомок) Буенка». Суффикс -к- здесь не уменьшительно-ласкательный, а скорее обиходный, разговорный — так в быту могли называть человека по его прозвищу, добавляя оттенок фамильярности.

Стоит отметить, что фамилия Буенков — не единственная в этом гнезде. Однокоренные Буйнов, Буянов, Буенко, Буйко образованы от той же основы, но с разными суффиксами. Буенков звучит несколько архаичнее, чем, скажем, Буйнов, и могла закрепиться в среде, где была распространена модель с суффиксом -к- (в основном в северных и центральных областях России, а также в среде казачества).

Встречается и более редкая версия, связывающая фамилию с географическим названием: в некоторых говорах «буй» — это возвышенное открытое место, курган или кладбище. В этом случае Буенковым могли назвать человека, жившего на таком бугре или рядом с погостом. Однако эта гипотеза менее вероятна, так как прозвища по местности обычно образовывались через суффиксы -ский/-цкий (Буйский), а не через -к-ов.

Сословно фамилия Буенков, скорее всего, принадлежала крестьянам или однодворцам. В дворянских родословных книгах она не встречается, что подтверждает её «низовое» происхождение — из прозвища, данного в деревне.