Фамилия Букулит — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Она явно не входит в число типичных русских фамилий на -ов, -ев или -ин. Её форма сразу выдаёт либо иноязычные корни, либо искусственное происхождение (например, семинарскую фамилию, образованную от латинского или греческого слова).

Скорее всего, основа фамилии — латинское слово buculus, что значит «бычок» или «молодой бык». В таком случае Букулит — это русифицированная форма латинского прилагательного buculatus (имеющий отношение к бычку) или уменьшительного buculitus. Подобные фамилии давали в духовных семинариях XVIII–XIX веков: ученикам, отличавшимся крепким телосложением, упрямством или просто по капризу наставника, присваивали «учёные» фамилии на латыни. Букулит мог быть переосмыслением более простой русской фамилии Быков или Бычков — в благозвучный латинский эквивалент.

Менее вероятная, но возможная версия — происхождение от диалектного прозвища. В некоторых говорах «букул» или «букуля» могло означать нечто вздутое, набухшее, или же человека с крупными чертами лица. Однако письменных подтверждений такого прозвища в русской ономастике нет, и версия с латинским корнем выглядит надёжнее.

Географически фамилия встречается единично, преимущественно на юге России и в Западной Сибири, что косвенно подтверждает её семинарское происхождение: выпускники духовных училищ разъезжались по всей стране. Суффикс -ит в русских фамилиях нетипичен — он встречается в латинизированных формах (сравните фамилии Адонит, Аквилит), что ещё раз указывает на книжный, а не народный путь образования.

Таким образом, носитель фамилии Букулит, скорее всего, потомок человека, получившего прозвище «бычок» в латинском облачении — либо за характер, либо за внешность, либо просто потому, что так решил преподаватель семинарии.