Фамилия Булискерия — случай редкий и этимологически непрозрачный. С первого взгляда в ней угадывается иноязычная основа, нехарактерная для типичной русской фамильной модели. В русском языке нет корня «булискер», а суффикс -ия указывает на возможное заимствование или искусственное происхождение.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию с грузинским или мегрельским миром. В грузинских фамилиях часты окончания -ия, -иа, -ая (например, Гулия, Берия, Данелия). Основа «Булискер» может восходить к грузинскому слову «були» (ბული) — «ребёнок, отпрыск», или к «булисквер» (буквально «потомок»). В таком случае Булискерия — это патронимическая фамилия, означающая «принадлежащий к роду Булискера» или «сын Булискера». Ударение, скорее всего, падает на предпоследний слог: Булиске́рия.

Менее убедительная, но возможная версия — греческое происхождение. В понтийском диалекте греческого языка есть слово «були» (βούλη) — «совет, воля», но суффикс -скерия не находит прямых аналогов. Связь с турецким или арабским корнями также маловероятна из-за отсутствия в этих языках типичных для фамилии аффиксов.

География фамилии сегодня — почти исключительно Россия, с единичными носителями в Абхазии и Грузии. В дореволюционных метрических книгах фамилия не встречается, что говорит о её позднем оформлении или бытовании в узком кругу. Возможно, первоначально это было уличное прозвище, которое при советской паспортизации записали как фамилию.

Фамилия не имеет отношения к славянским суффиксам -ов/-ев или -ин, поэтому её носители — не потомки крестьян центральной России, а выходцы с Кавказа или из греческих поселений Причерноморья. Точное значение без привлечения семейных архивов и диалектных словарей установить сложно, но грузинская версия остаётся основной.